More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4647 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  93.42 
 
 
304 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  79.28 
 
 
303 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  76.08 
 
 
306 aa  491  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  71.05 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  71.05 
 
 
303 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  64.41 
 
 
302 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  59.87 
 
 
304 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  59.93 
 
 
296 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  57.91 
 
 
310 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  57.19 
 
 
299 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  57.81 
 
 
312 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  54.82 
 
 
308 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.22 
 
 
300 aa  334  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  53.31 
 
 
308 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  57.19 
 
 
322 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  57.14 
 
 
316 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  57.33 
 
 
313 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  57.33 
 
 
313 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  57.33 
 
 
316 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  57.33 
 
 
313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  57.33 
 
 
313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  55.7 
 
 
316 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  53.51 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  58.47 
 
 
315 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  54.97 
 
 
312 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  52.35 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  54.67 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  54.33 
 
 
307 aa  319  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  55.3 
 
 
313 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  57.14 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  51.95 
 
 
324 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  50 
 
 
310 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  50.32 
 
 
350 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  49.84 
 
 
357 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  51.16 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  47.74 
 
 
352 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  50.16 
 
 
353 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  45.99 
 
 
362 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.15 
 
 
368 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  46.2 
 
 
366 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  47.99 
 
 
281 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  45.86 
 
 
363 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  47.35 
 
 
323 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  45.58 
 
 
286 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.48 
 
 
407 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  45.22 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  46.64 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  46.64 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  47.25 
 
 
281 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  44.9 
 
 
372 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  46.92 
 
 
281 aa  248  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  44.07 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  46.05 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  41.75 
 
 
338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  41.08 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  42.18 
 
 
338 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  40.88 
 
 
371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  42.33 
 
 
325 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  40.07 
 
 
338 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.54 
 
 
415 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.01 
 
 
314 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.82 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  38.74 
 
 
343 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  39.26 
 
 
533 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  43.5 
 
 
247 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  38.62 
 
 
318 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  40.36 
 
 
334 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.37 
 
 
351 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.14 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.11 
 
 
342 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  52.46 
 
 
183 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  52.46 
 
 
183 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  44.98 
 
 
353 aa  165  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  33.77 
 
 
545 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  35.33 
 
 
339 aa  159  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  64.6 
 
 
131 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  64.6 
 
 
131 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  29.63 
 
 
340 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.72 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  28.7 
 
 
398 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.85 
 
 
340 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.06 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.35 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  36.82 
 
 
477 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.81 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.29 
 
 
581 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.53 
 
 
197 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.02 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  31.2 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.68 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  31.2 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.63 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  42.57 
 
 
123 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  29.1 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 
569 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.3 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.3 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  32.35 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  29.06 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>