214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1491 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  100 
 
 
327 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  50.47 
 
 
310 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  47.12 
 
 
303 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  48.24 
 
 
304 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  46.18 
 
 
304 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  48.26 
 
 
302 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.66 
 
 
310 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  45.19 
 
 
306 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  45.22 
 
 
304 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  44.55 
 
 
303 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  44.23 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  45.83 
 
 
308 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  46.08 
 
 
308 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  46.13 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  45.82 
 
 
307 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  43.99 
 
 
304 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.89 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  44.58 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  43.91 
 
 
296 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  42.23 
 
 
286 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  43.99 
 
 
315 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  43.85 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  43.85 
 
 
316 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  43.85 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  43.85 
 
 
313 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  43.85 
 
 
313 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  43.22 
 
 
322 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  41.72 
 
 
281 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  43.35 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  41.03 
 
 
281 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  43.96 
 
 
302 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  42.19 
 
 
313 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  42.9 
 
 
312 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.8 
 
 
300 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  43.4 
 
 
316 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  40.24 
 
 
352 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  42.45 
 
 
332 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  40.55 
 
 
350 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  41.08 
 
 
304 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  40.18 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  40.31 
 
 
353 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.69 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.72 
 
 
368 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  37.38 
 
 
295 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  37.38 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  37.08 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  38.32 
 
 
363 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  36.94 
 
 
366 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  37.06 
 
 
338 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  40.94 
 
 
287 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  38.17 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  39.94 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  36.18 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  40.94 
 
 
281 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  37.65 
 
 
338 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  39.41 
 
 
314 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  39.29 
 
 
328 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  38.96 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  39.42 
 
 
325 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  37.66 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.29 
 
 
407 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.99 
 
 
533 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  33.43 
 
 
371 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  32.51 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.77 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  35.05 
 
 
339 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  34.21 
 
 
342 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  41.13 
 
 
247 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  32.21 
 
 
351 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  35.45 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.22 
 
 
406 aa  146  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  27.67 
 
 
340 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  32.42 
 
 
334 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  30.33 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.1 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  38.69 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  38.69 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.95 
 
 
307 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  36.36 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.25 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.52 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.51 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  50.86 
 
 
131 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  50.86 
 
 
131 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.94 
 
 
334 aa  89  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  40.43 
 
 
123 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  30.59 
 
 
477 aa  79.3  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.61 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.61 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.07 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34 
 
 
197 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1013  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.16 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.62 
 
 
581 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.82 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.14 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.03 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.01 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.09 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  27.4 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.96 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>