More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3985 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 318 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 318 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  84.57 
 
 		 309 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  79.62 
 
 		 313 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  80.06 
 
 		 309 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  79.62 
 
 		 313 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  78.66 
 
 		 313 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  67.85 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  67.85 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.82 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.89 
 
 		 298 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.89 
 
 		 298 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.61 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  54.93 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  56.25 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.93 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  54.33 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  54.28 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  47.51 
 
 		 304 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  45.15 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  42.02 
 
 		 594 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.21 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.46 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.96 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  29.75 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.55 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  30.11 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  28.87 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  30.07 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  27.84 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.32 
 
 		 302 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  28.19 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  28.52 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  29.47 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.57 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  32.71 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  31.37 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.45 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  28.73 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  27.86 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  27.44 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.96 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.6 
 
 		 581 aa  92.8  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  27.97 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  27.44 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  30.77 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.18 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  27.44 
 
 		 316 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  27.44 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  27.44 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  29.47 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  27.5 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  30.22 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  29.59 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.49 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  28.36 
 
 		 545 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  28.1 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  31.1 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.49 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.35 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.6 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  29.1 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  28.21 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  27.44 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  28.57 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  30.37 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  29.49 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  29.41 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  27.62 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  29.06 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  28.24 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  28.84 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  28.52 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  26.26 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.79 
 
 		 579 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.37 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  28.68 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  30.74 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  28.11 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  28.73 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  26.69 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.78 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.78 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.04 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.98 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  27.9 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  29.59 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.49 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.57 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  25.65 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  25.74 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  28.42 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  29.06 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  26.59 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1040  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.37 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  27.82 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>