269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4512 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  58.78 
 
 
307 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.42 
 
 
298 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  60.42 
 
 
298 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  58.59 
 
 
307 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.33 
 
 
318 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.33 
 
 
318 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.31 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55.29 
 
 
309 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.72 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.38 
 
 
309 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.15 
 
 
306 aa  315  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  53.16 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  53.38 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.38 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  55 
 
 
307 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  50.83 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  48.84 
 
 
307 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  46.23 
 
 
304 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  46.28 
 
 
323 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  42.42 
 
 
594 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.13 
 
 
275 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  30.59 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.87 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.52 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.52 
 
 
324 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.04 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  29.87 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  28.86 
 
 
306 aa  89  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.33 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.11 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.76 
 
 
317 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  28.74 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.63 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.68 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.73 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  27.42 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.3 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.81 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  28.44 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  27.81 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.44 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  28.44 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.48 
 
 
579 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.57 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.78 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  30.22 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.67 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.84 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.84 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.19 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  28.98 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.92 
 
 
581 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.01 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  26.69 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.53 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  26.97 
 
 
545 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.61 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.87 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  30.04 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  30.45 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.61 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.63 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  26.32 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  27.78 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  29.27 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.49 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  23.49 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  24.49 
 
 
353 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  26.85 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  30.08 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  28.05 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  25.35 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  26.01 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2099  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.83 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  25 
 
 
352 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  28.38 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.1 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.38 
 
 
319 aa  62.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  28.43 
 
 
334 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  26.52 
 
 
328 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.3 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  28.17 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  28.31 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  28.31 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  26.09 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  23.42 
 
 
366 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.59 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.13 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  28.37 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  27.5 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  26.79 
 
 
303 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  26.79 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3180  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  26.18 
 
 
346 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  24.9 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  28.29 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.94 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  24.43 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  29.82 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>