247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2803 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  100 
 
 
372 aa  770    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  82.77 
 
 
363 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  80.51 
 
 
366 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  63.52 
 
 
352 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  58.69 
 
 
350 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  63.01 
 
 
357 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  61.2 
 
 
324 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  54.11 
 
 
353 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  59.37 
 
 
322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  54.79 
 
 
362 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  56.33 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.36 
 
 
368 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  56.69 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  55.38 
 
 
312 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  56.13 
 
 
316 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  55.08 
 
 
316 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  56.92 
 
 
313 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  56.92 
 
 
313 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  56.92 
 
 
313 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  55.21 
 
 
313 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  56.92 
 
 
313 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  55.21 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  51.42 
 
 
332 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.48 
 
 
300 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  46.86 
 
 
303 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  45.74 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  46.18 
 
 
304 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  44.9 
 
 
304 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  42.9 
 
 
303 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  45.4 
 
 
296 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  44.84 
 
 
303 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  42.27 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  43.17 
 
 
304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  43.97 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  42.04 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  42.51 
 
 
371 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  41.53 
 
 
307 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.5 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  41.53 
 
 
307 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  43.54 
 
 
302 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  39.44 
 
 
343 aa  225  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  41.4 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  41.4 
 
 
308 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.43 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  41.67 
 
 
302 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.29 
 
 
415 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.1 
 
 
406 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  37.08 
 
 
327 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  54.26 
 
 
183 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  54.26 
 
 
183 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  38.31 
 
 
286 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.88 
 
 
318 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  65.15 
 
 
197 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  35.01 
 
 
310 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  37.05 
 
 
281 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  38.31 
 
 
281 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  37.84 
 
 
287 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  36.48 
 
 
281 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  35.47 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  35.4 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  34.69 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  35.31 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  33.24 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.2 
 
 
545 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  33.44 
 
 
351 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  58.09 
 
 
131 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  58.09 
 
 
131 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  36.7 
 
 
334 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.45 
 
 
533 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  33.56 
 
 
338 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  32 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  32.52 
 
 
314 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  33 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.74 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.74 
 
 
340 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.43 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  31.94 
 
 
295 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  30.35 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.14 
 
 
334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  32.37 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.81 
 
 
307 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.36 
 
 
302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  34.19 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  24.72 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.91 
 
 
339 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  31.5 
 
 
353 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.5 
 
 
477 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.52 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.67 
 
 
581 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.74 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.6 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.14 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.37 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.18 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.79 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.79 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  24.27 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  41.67 
 
 
123 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>