More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4181 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  100 
 
 
340 aa  695    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  48.69 
 
 
318 aa  309  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  48.72 
 
 
351 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  46.33 
 
 
342 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  44.98 
 
 
339 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  42.55 
 
 
545 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  49.31 
 
 
281 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  47.55 
 
 
287 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  43.55 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  37.5 
 
 
340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  40.32 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.81 
 
 
324 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  38.41 
 
 
296 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.42 
 
 
300 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  38.41 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  33.14 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  41.22 
 
 
328 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  41.22 
 
 
328 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  38.92 
 
 
302 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  38.4 
 
 
350 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  38.27 
 
 
352 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  41.47 
 
 
323 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  39.05 
 
 
315 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  38.26 
 
 
304 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  38.8 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  38.68 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  37.85 
 
 
357 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  37.3 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  36.14 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 
366 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.22 
 
 
310 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  38.61 
 
 
312 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  37.26 
 
 
304 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  36.96 
 
 
306 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  36.91 
 
 
312 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  34.21 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  37.14 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  37.3 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  36.96 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  37.3 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  36.76 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  36.76 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  37.3 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  36.86 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  37.5 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  36.79 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  33.63 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  36.89 
 
 
310 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  38.26 
 
 
299 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  35.36 
 
 
363 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  35.16 
 
 
353 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  38.39 
 
 
325 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  35.46 
 
 
308 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  36.43 
 
 
334 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  36.54 
 
 
533 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  33.83 
 
 
362 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  35.81 
 
 
307 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  37.71 
 
 
286 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.48 
 
 
368 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  34.8 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  36.99 
 
 
281 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  33.24 
 
 
372 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.78 
 
 
407 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  35.76 
 
 
338 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  34.8 
 
 
307 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  34.63 
 
 
295 aa  159  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  36.15 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  36.49 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  34.7 
 
 
338 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.24 
 
 
415 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  34.44 
 
 
314 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  35.45 
 
 
327 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  37.31 
 
 
247 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.95 
 
 
406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  34.06 
 
 
343 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.3 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.35 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  33.33 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  28.81 
 
 
353 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.42 
 
 
581 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.24 
 
 
307 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.02 
 
 
303 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.85 
 
 
302 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.3 
 
 
297 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  30.19 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.91 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  42.06 
 
 
131 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  42.06 
 
 
131 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  33.51 
 
 
183 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  33.51 
 
 
183 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  30.63 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  28.52 
 
 
299 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.39 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.71 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.71 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 
579 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.18 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  28.95 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.64 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  28.95 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>