260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3691 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  96.09 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  78.6 
 
 		 286 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  52.59 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  50 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  51.46 
 
 		 303 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  47.99 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  47.83 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  47.25 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  46.74 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  44.53 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  47.27 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  48.18 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  46.91 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  44.76 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  44.69 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.93 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  46.55 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  45.42 
 
 		 302 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.93 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  45.29 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  42.7 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  41.03 
 
 		 327 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.07 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  41.58 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  42.28 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  41.2 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  44.16 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  39.42 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  39.93 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  41.4 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  39.86 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  39.38 
 
 		 353 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  39.51 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  41.67 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  39.05 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.7 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  41.67 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  41.32 
 
 		 313 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  41.32 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  41.32 
 
 		 313 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  37.86 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  43.27 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  40 
 
 		 338 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  39.72 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  40.07 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  41.39 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  39.93 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  39.37 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  36.65 
 
 		 338 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  37.88 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  35.94 
 
 		 338 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.22 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  38.62 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  37 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  37.46 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  36.86 
 
 		 352 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.54 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  36.48 
 
 		 372 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  36.58 
 
 		 342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  35.27 
 
 		 371 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  39.37 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.67 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  36.99 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.56 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.15 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.08 
 
 		 407 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.27 
 
 		 545 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  34.07 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.13 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  33.58 
 
 		 533 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  33.1 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.64 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  33.33 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.1 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  38.8 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  38.8 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.82 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  24.12 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.1 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  44.55 
 
 		 131 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  44.55 
 
 		 131 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  31.84 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.41 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.41 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  26.52 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.3 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  28.35 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  29.79 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.24 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.14 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  31.41 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.14 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  42.67 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.81 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.81 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>