More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1111 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  100 
 
 		 324 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  70.25 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  69.52 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  68.35 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  63.41 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  62.78 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  64.47 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  61.2 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  58.86 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  64.13 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  62.74 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  58.51 
 
 		 368 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  61.86 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  61.86 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  61.86 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  61.86 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  61.86 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  60.06 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  61.15 
 
 		 312 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  60.7 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  59.94 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  59.37 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  57.59 
 
 		 332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  52.6 
 
 		 304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  51.62 
 
 		 303 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  51.3 
 
 		 296 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  51.95 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  50.32 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  48.55 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.54 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  50.65 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  49.52 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.09 
 
 		 310 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  49.03 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  49.2 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.99 
 
 		 407 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  47.7 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  45.31 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  48.32 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  46.6 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  46.91 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  46.8 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.29 
 
 		 415 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  45.78 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  43.33 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  42.22 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.23 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.04 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  39.69 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  40.19 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  40.51 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  55.61 
 
 		 183 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  55.61 
 
 		 183 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  39.73 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  39.5 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  41.28 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  39.81 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  41.16 
 
 		 287 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  39.58 
 
 		 281 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  38.44 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  38.62 
 
 		 281 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  70.73 
 
 		 131 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  70.73 
 
 		 131 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  66.67 
 
 		 197 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  36.68 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  36.05 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  39.06 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  34.94 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  35.44 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  35.67 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.18 
 
 		 545 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.62 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  32.89 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  35.22 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  33.97 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  33.02 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  34.31 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  35.2 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  38.37 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.71 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.31 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.21 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  25.78 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.36 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  33.33 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  29.63 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.74 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.18 
 
 		 477 aa  99.8  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.52 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.52 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  28.46 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.4 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.81 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.4 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.4 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  29.78 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  30.34 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.05 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.26 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  31.23 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>