275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2162 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  56.82 
 
 		 579 aa  684    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 581 aa  1197    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5718  putative esterase  65.75 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0594  putative esterase  46.39 
 
 		 343 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1351  putative esterase  48.67 
 
 		 298 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13750  enterochelin esterase-like enzyme  36.64 
 
 		 281 aa  156  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0322  putative esterase  34.83 
 
 		 286 aa  150  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0574968  normal  0.0221757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.44 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.21 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.72 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.88 
 
 		 306 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  26.33 
 
 		 281 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  29.54 
 
 		 302 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  29.29 
 
 		 304 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.6 
 
 		 300 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  28.62 
 
 		 304 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  25.98 
 
 		 287 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  28.47 
 
 		 306 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  29.19 
 
 		 304 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  28.96 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  30.74 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  29.29 
 
 		 323 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  30.94 
 
 		 299 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  30 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  25.91 
 
 		 304 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  27.42 
 
 		 340 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  26.42 
 
 		 316 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  26.42 
 
 		 313 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  26.42 
 
 		 313 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.37 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  26.42 
 
 		 313 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  26.42 
 
 		 313 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  30.04 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  27.74 
 
 		 324 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  28.05 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.42 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  27.7 
 
 		 328 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  27.36 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  25 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  29.15 
 
 		 303 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.98 
 
 		 310 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  28.06 
 
 		 304 aa  99.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  27.36 
 
 		 352 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  27.27 
 
 		 353 aa  97.4  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  27.61 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  27.04 
 
 		 302 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26.76 
 
 		 315 aa  94.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.74 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  25.93 
 
 		 312 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  25.75 
 
 		 313 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  29.33 
 
 		 303 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  27.33 
 
 		 308 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.6 
 
 		 318 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.12 
 
 		 295 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.6 
 
 		 318 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  27.65 
 
 		 296 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  26.71 
 
 		 362 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  25.93 
 
 		 316 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  26.87 
 
 		 357 aa  90.5  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  25.58 
 
 		 325 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  25.08 
 
 		 338 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  25.24 
 
 		 338 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.9 
 
 		 292 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.12 
 
 		 275 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.34 
 
 		 307 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.17 
 
 		 296 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.76 
 
 		 307 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  25.45 
 
 		 334 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.07 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  24.44 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  28.25 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.72 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  25.87 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  25.87 
 
 		 312 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.07 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  25.16 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  23.83 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  29.23 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  24.67 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.82 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  25.47 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.12 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.65 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  24.36 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  23.91 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  26.71 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.7 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  28.74 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  26.35 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  26.15 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  24.06 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  27.51 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.28 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.28 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  23.2 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  28.85 
 
 		 297 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.8 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.64 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>