More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4442 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  100 
 
 
316 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  79.11 
 
 
316 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  79.55 
 
 
313 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  79.55 
 
 
313 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  83.55 
 
 
313 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  79.55 
 
 
313 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  79.55 
 
 
313 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  82.52 
 
 
312 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  68.63 
 
 
322 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  69.06 
 
 
315 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  67.43 
 
 
312 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  65.47 
 
 
316 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  61.02 
 
 
357 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  60.06 
 
 
324 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  60.26 
 
 
352 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  58.65 
 
 
350 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  57.38 
 
 
332 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  55.08 
 
 
372 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  56.87 
 
 
353 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  54.43 
 
 
366 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  54.13 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  52.57 
 
 
368 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  52.12 
 
 
362 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  55.7 
 
 
304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  56.38 
 
 
304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  55.37 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  56.38 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  55.52 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  54.85 
 
 
303 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54 
 
 
310 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  79.23 
 
 
183 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  79.23 
 
 
183 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  54.05 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  52.51 
 
 
307 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  50 
 
 
304 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  52.68 
 
 
296 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  51.16 
 
 
308 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  52.51 
 
 
302 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  51.17 
 
 
307 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  49 
 
 
308 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  50.17 
 
 
300 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  49.17 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  44.86 
 
 
371 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  49.66 
 
 
302 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  47.99 
 
 
304 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  44.69 
 
 
343 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.74 
 
 
407 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.36 
 
 
415 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.26 
 
 
406 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  44.73 
 
 
310 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  44.74 
 
 
323 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  44.44 
 
 
328 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  44.41 
 
 
328 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  43.35 
 
 
327 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  78.63 
 
 
131 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  78.63 
 
 
131 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  43.36 
 
 
286 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  46.29 
 
 
287 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.23 
 
 
281 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  41.05 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  37.34 
 
 
338 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  40.95 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  39.37 
 
 
281 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  36.69 
 
 
338 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  38.41 
 
 
340 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  40.48 
 
 
314 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.9 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.9 
 
 
351 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  37.58 
 
 
295 aa  185  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  38.12 
 
 
342 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  36.36 
 
 
338 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  36.21 
 
 
533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  38.87 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  34.1 
 
 
338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  35.69 
 
 
545 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  39.29 
 
 
247 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.27 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  44.26 
 
 
353 aa  145  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  57.25 
 
 
197 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  28.53 
 
 
340 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  32.71 
 
 
339 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.58 
 
 
307 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  32.48 
 
 
340 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.88 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.72 
 
 
398 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.42 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  35.71 
 
 
477 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 
581 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  28.63 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  29.48 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  28.2 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.15 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.74 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.69 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.74 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.69 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.15 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.04 
 
 
569 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.55 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.13 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>