167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2641 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  100 
 
 		 398 aa  828    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  35.41 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.95 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  34 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  33.14 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  30.68 
 
 		 339 aa  176  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  30.57 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  32.56 
 
 		 545 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  33.02 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.06 
 
 		 533 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.39 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  31.69 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.34 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  29.19 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  28.77 
 
 		 306 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  29.19 
 
 		 304 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.57 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  26.78 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  28.7 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  27.84 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  27.65 
 
 		 308 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  28.74 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  26.21 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  27 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  27.3 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  27.43 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  27 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  27 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.29 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  27.3 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  26.72 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  25.91 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  27.33 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  27.44 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  26.7 
 
 		 312 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  25.78 
 
 		 324 aa  123  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  29.86 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.51 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  27.67 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  29.58 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  26.32 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  27.22 
 
 		 353 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  24.64 
 
 		 295 aa  120  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  26.5 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  26.55 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  26.44 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  26.7 
 
 		 310 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  25.28 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  26.18 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  25.93 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  27.21 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  24.5 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  24.5 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  24.5 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  25.57 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  24 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  24 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  26.22 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  25.44 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  25.4 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  24.72 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.13 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  26.52 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.52 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  24.93 
 
 		 281 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.53 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  24.12 
 
 		 281 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  24.78 
 
 		 286 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  24.86 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.54 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  26.45 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  23.78 
 
 		 343 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.49 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  26.3 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.8 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  31.15 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.22 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  22.22 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  27.01 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  27.01 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  23.66 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.74 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  40.54 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.88 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.63 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.28 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.95 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.09 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.49 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.49 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.36 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.36 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  35.43 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  33.94 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0517  gluconolactonase  31.39 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.71 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  33.12 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>