More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2498 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  92.17 
 
 		 281 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  50.72 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  49.65 
 
 		 303 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  47.26 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  46.05 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  48.56 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  45.76 
 
 		 545 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  45.83 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  45.96 
 
 		 533 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  45.89 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  47.55 
 
 		 340 aa  232  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  47.87 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  44.77 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  43.29 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  46.55 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  44.37 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  44.33 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  45.33 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  45.02 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  44.63 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  45.23 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.69 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  44.57 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  45.52 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  45.42 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  46.26 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  43.86 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  44.88 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  43.48 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  46.29 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  44.36 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  44.37 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  44.37 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  44.37 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  43.82 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  43.82 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  42.11 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  43.42 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  44.16 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  44.79 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  44.67 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  43.4 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.48 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  44.33 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  42.57 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.34 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  43.27 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  42.66 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  42.32 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  40.21 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  42.86 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  40.94 
 
 		 327 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  41.16 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  41.81 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  39.26 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  37.29 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.03 
 
 		 368 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  37.63 
 
 		 338 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  40.83 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  38.1 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  40.45 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  39.77 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  37.96 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  38.91 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  38.44 
 
 		 366 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  37.59 
 
 		 338 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.46 
 
 		 334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.17 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  37.84 
 
 		 372 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.96 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.39 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  36.48 
 
 		 371 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  37.5 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.59 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  36.84 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  31.69 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  37.19 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.93 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.82 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  42.16 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  42.16 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.64 
 
 		 579 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  38.28 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.98 
 
 		 581 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.59 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.14 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.64 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  31.06 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.35 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.35 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.48 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.84 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.74 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.39 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.27 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.96 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 		 306 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.09 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.35 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>