265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1059 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  61.2 
 
 
300 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  56.42 
 
 
296 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  53.85 
 
 
306 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  53.02 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  54.03 
 
 
303 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  54.03 
 
 
304 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  53.02 
 
 
303 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  52.35 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  52.35 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  50.68 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  50.17 
 
 
332 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  48.34 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  49.33 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  46.86 
 
 
304 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  47.84 
 
 
312 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  50.51 
 
 
315 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  49.33 
 
 
307 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  48.65 
 
 
308 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  48.83 
 
 
308 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  48.18 
 
 
307 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  47.68 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  47.33 
 
 
316 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  45.31 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  47.83 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  47.84 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  47.84 
 
 
313 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  47.84 
 
 
313 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  47.02 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  47.84 
 
 
313 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  47.84 
 
 
313 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  44.48 
 
 
357 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  43.65 
 
 
350 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  47.99 
 
 
316 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  43.32 
 
 
352 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  42.81 
 
 
366 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  43.95 
 
 
363 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  47.14 
 
 
302 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  42.72 
 
 
353 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  43.17 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  46.04 
 
 
286 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  38.51 
 
 
362 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  41.23 
 
 
310 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  43.64 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  44.33 
 
 
287 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.54 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  43.75 
 
 
281 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  41.08 
 
 
327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  42.28 
 
 
281 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  43.3 
 
 
328 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  39.47 
 
 
343 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  44.65 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  39.1 
 
 
295 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  43.6 
 
 
323 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  36.75 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  36.75 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.07 
 
 
407 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  41.83 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  40.97 
 
 
533 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.18 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.48 
 
 
415 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  38.26 
 
 
340 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  37.1 
 
 
371 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  36.3 
 
 
338 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  38.57 
 
 
314 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.49 
 
 
351 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  35.86 
 
 
342 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  36.27 
 
 
325 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  38.29 
 
 
545 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  35.57 
 
 
334 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  45.16 
 
 
183 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  45.16 
 
 
183 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.23 
 
 
406 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  39.13 
 
 
247 aa  148  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  34.6 
 
 
339 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  28.93 
 
 
340 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  38.61 
 
 
353 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  32.06 
 
 
340 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.83 
 
 
307 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.5 
 
 
398 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.07 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  50.44 
 
 
131 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  50.44 
 
 
131 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  35 
 
 
477 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.68 
 
 
334 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.91 
 
 
581 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.93 
 
 
302 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.82 
 
 
197 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04004  lactonohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08990)  28.19 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.162257  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.07 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  29.96 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  30.24 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  30.23 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36900  gluconolactonase  37.25 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.433701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  31.18 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  30.65 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.19 
 
 
579 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  39.56 
 
 
123 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>