More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2396 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
275 aa  552  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  34.96 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  31.85 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.91 
 
 
298 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.91 
 
 
298 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.35 
 
 
307 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  36.13 
 
 
305 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.23 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.22 
 
 
307 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.73 
 
 
306 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.35 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  34.1 
 
 
307 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.21 
 
 
318 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.21 
 
 
318 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.84 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  33.87 
 
 
307 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.97 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.33 
 
 
313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.84 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.95 
 
 
309 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.01 
 
 
334 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  31.45 
 
 
292 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.82 
 
 
317 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.33 
 
 
290 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  31.64 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.05 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.47 
 
 
305 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.53 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  31.32 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  32.3 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.46 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.36 
 
 
307 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
303 aa  92  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  29.09 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.18 
 
 
309 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29.57 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.62 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.12 
 
 
581 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  29.56 
 
 
281 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  29.54 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  30.18 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.42 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.03 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.42 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.76 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.37 
 
 
579 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  30.67 
 
 
325 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.53 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  33.33 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  29.43 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.98 
 
 
305 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  32.41 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  27.82 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  28.46 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  29.23 
 
 
545 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  26.64 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  28.1 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  29.39 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.51 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  27.6 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  30.32 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  25.18 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  30.56 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  26.55 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  26.24 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  29.86 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.4 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  29.03 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.22 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  30.77 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  30.77 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1102  gluconolactonase, putative  28.57 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  29.36 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  28.83 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  27.94 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.61 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  32.95 
 
 
363 aa  72  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.23 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  29.02 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.35 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  25.38 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  26.67 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  33.95 
 
 
594 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  27.57 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  25.56 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  29.45 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  29.3 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  28.32 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  28.57 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.05 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  26.96 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  30.86 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  26.14 
 
 
542 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  25 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  26.73 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  27.16 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  33.57 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.13 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  28.52 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>