149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1217 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  100 
 
 		 337 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  100 
 
 		 337 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  98.22 
 
 		 337 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  68.1 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  66.87 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  40.06 
 
 		 599 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.83 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  41.23 
 
 		 307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  32.84 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  33.43 
 
 		 354 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  33.63 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  32.04 
 
 		 363 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  35.29 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  29.82 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  30.59 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  31.53 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 706 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 704 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  32.6 
 
 		 707 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  33.23 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  25.75 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.63 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.56 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.16 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.35 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.85 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.77 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  29.95 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.7 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.3 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.3 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.92 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  28.11 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  27.68 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.84 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  29.2 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.4 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.8 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.23 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  40.22 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  40.22 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  40.22 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  27.04 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  28.42 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.32 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.32 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.32 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  28.31 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.51 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  29.19 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.38 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  26.73 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26.9 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2303  gluconolactonase  25.68 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  26.2 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  25.61 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  23.47 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  25.36 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  24.08 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  24.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  27.59 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  24.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  24.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  25 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  24.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.18 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  29.94 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  24.75 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  24.77 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1002  gluconolactonase  27.98 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.968927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  26.94 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  25.64 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  28.66 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  28.92 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  26.6 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  27.98 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.17 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.46 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.22 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.22 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  25.25 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7307  gluconolactonase  37.37 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  27.93 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  23.18 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  25.59 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  22.22 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  24.1 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  26.71 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  25.37 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  23.76 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  26.53 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  23.56 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.25 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  23.81 
 
 		 280 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2741  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30 
 
 		 290 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29900  gluconolactonase  29.58 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>