39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3429 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  100 
 
 		 358 aa  726    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  60.8 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  43.95 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  43.28 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  41.49 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  41.19 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  37.61 
 
 		 358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  34.68 
 
 		 707 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  35.84 
 
 		 599 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 706 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 704 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  31.56 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  34.15 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  31.91 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  30.84 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  29.52 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  27.57 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  29.52 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.85 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  29.63 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  31 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  31.43 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  26.8 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  23.83 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  24.86 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.76 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  24.29 
 
 		 533 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.42 
 
 		 279 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.45 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  24.26 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  24.34 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  21.27 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  24.31 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  24.02 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  27.59 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  27.59 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  27.59 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  23.35 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.47 
 
 		 282 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>