36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3293 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  100 
 
 
367 aa  737    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  56.15 
 
 
365 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  37.34 
 
 
400 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  27.24 
 
 
707 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  24.1 
 
 
353 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  26.57 
 
 
706 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  22.99 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  26.37 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  25 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  23.94 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  27.48 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  28.45 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  27.7 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  26.2 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  26.2 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  29.05 
 
 
599 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  24.86 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  25.81 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  27.84 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  26.51 
 
 
337 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  25.49 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  26.79 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  36.78 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  36.78 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  36.78 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.53 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 
538 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.03 
 
 
545 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  43.64 
 
 
543 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  40 
 
 
542 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  32.43 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.94 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  36.62 
 
 
542 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.86 
 
 
612 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.07 
 
 
574 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.04 
 
 
296 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>