100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2400 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  100 
 
 		 363 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  44.12 
 
 		 358 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  42.36 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  44.14 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  41.72 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  36.63 
 
 		 599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  31.98 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  33.14 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  36.07 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 706 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  35.29 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  37.05 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  35.29 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  35.12 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  34.74 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  30.62 
 
 		 707 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.86 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  35.36 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  34.74 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 704 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  29.5 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  28.45 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2553  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.75 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  25.82 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.24 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  27.46 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.88 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  26.96 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.96 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.49 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.82 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  27.92 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  26.92 
 
 		 545 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  26.87 
 
 		 642 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2018  gluconolactonase  31.18 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2001  gluconolactonase  31.18 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  27.45 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2064  gluconolactonase  31.18 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  30.41 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  28.67 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  32 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  26.92 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  29.23 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  25.23 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.67 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.94 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.05 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  25.73 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.19 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  29.52 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  26.67 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.45 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  29.14 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  26.47 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  32 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.94 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.98 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.45 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.23 
 
 		 307 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.45 
 
 		 313 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  27.68 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  27.45 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.53 
 
 		 268 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  25.96 
 
 		 312 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  27.45 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.55 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.55 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  27.45 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  30.95 
 
 		 325 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.75 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  25.82 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  28.06 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.23 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  28.06 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  27.45 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  27.45 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  29.01 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.31 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2119  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.9 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  28.27 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.91 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  25.88 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  26.14 
 
 		 325 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6822  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.86 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.09 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  25.49 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  30.07 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.61 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  32.61 
 
 		 477 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  25.76 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  27.64 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.29 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  25 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>