More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4272 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  74.26 
 
 		 307 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  64.82 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.89 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  64.82 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  65.02 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.22 
 
 		 309 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  64.88 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.88 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  64.88 
 
 		 313 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  58.78 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  51.32 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.02 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.02 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.98 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.32 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  51.16 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  48.5 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.66 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  46.98 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  43.02 
 
 		 594 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.23 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  32.96 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.89 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  29.53 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  33.33 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  32.59 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.52 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  30.36 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.24 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.77 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.06 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.59 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29.1 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.63 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.46 
 
 		 579 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.21 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3940  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.5 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.47 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  29.67 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  31.76 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.1 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.1 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  29.06 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  32.29 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  28.38 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  29.06 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.34 
 
 		 581 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  29.01 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  29.53 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.71 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  29.27 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.01 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.01 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.48 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.05 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  27.51 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  29.63 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  29.73 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.08 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  27.72 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  28.78 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.93 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  27.73 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  28.24 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.76 
 
 		 574 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.18 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  29.13 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  28.52 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  29.12 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  28.88 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  30.22 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.74 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.58 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  25.55 
 
 		 545 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  29.23 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.01 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.31 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  27.27 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  24.62 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  26.62 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  29.3 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  29.3 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.73 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  29.76 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.12 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.91 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1822  gluconolactonase  26.32 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  28.87 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  27.46 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  26.36 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  29.7 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  27.86 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  29.7 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1935  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.98 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  26.72 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>