More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3535 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  58.71 
 
 		 707 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  57.93 
 
 		 706 aa  775    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  100 
 
 		 704 aa  1418    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  35.94 
 
 		 353 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  35.44 
 
 		 353 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  36.12 
 
 		 354 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  35.82 
 
 		 363 aa  196  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  35.42 
 
 		 358 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  32.02 
 
 		 384 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  31.32 
 
 		 599 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 327 aa  148  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  32.39 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  32.39 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  32.61 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  34.43 
 
 		 363 aa  141  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  30.79 
 
 		 335 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 320 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 324 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 336 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  31.23 
 
 		 307 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  31.37 
 
 		 327 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 339 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  31.81 
 
 		 358 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 		 334 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 334 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 309 aa  134  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.91 
 
 		 323 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.99 
 
 		 331 aa  132  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 336 aa  132  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 310 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 		 835 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.53 
 
 		 322 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 		 310 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.48 
 
 		 322 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 312 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.27 
 
 		 327 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  33.97 
 
 		 322 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  30.94 
 
 		 314 aa  127  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  31.95 
 
 		 327 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.55 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.98 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 315 aa  126  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 341 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  30.59 
 
 		 324 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.51 
 
 		 322 aa  124  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 317 aa  123  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 341 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 341 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 		 337 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 316 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  31.35 
 
 		 321 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 346 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  30.41 
 
 		 321 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 		 356 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  29.78 
 
 		 341 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  30.72 
 
 		 321 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.56 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.7 
 
 		 358 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 330 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.39 
 
 		 330 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 330 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  31.45 
 
 		 335 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.63 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 311 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 311 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  30.99 
 
 		 324 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 348 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.11 
 
 		 311 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.63 
 
 		 341 aa  118  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 311 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.44 
 
 		 311 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.44 
 
 		 311 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 350 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 311 aa  118  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 346 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 346 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  31.17 
 
 		 335 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  31.19 
 
 		 321 aa  117  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.79 
 
 		 310 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 335 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  30.9 
 
 		 332 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.63 
 
 		 311 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>