More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2883 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  100 
 
 		 348 aa  673    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8258  ribose ABC transporter (permease)  78.9 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  decreased coverage  0.00803915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  61.38 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  60.12 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  61.25 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  57.45 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  59.93 
 
 		 356 aa  329  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  52.63 
 
 		 345 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  41.37 
 
 		 311 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.37 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.37 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  41.01 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.01 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.01 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.01 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.2 
 
 		 311 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.75 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  43.04 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  42.39 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.8 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 		 835 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 314 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.8 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  42.35 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  42.35 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.76 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  40 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.09 
 
 		 341 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  41 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.03 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.03 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.03 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  38.13 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  36.58 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.54 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.71 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.73 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  38.11 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.32 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.99 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  43.18 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  37.54 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3273  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  40.2 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  37.35 
 
 		 330 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 330 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  37.35 
 
 		 330 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.39 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 315 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>