More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2602 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  100 
 
 		 341 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  45.78 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  46.55 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6093  Monosaccharide-transporting ATPase  48.47 
 
 		 344 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  41.8 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  40.45 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  44.7 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.54 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.63 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.37 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.2 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.37 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  44.48 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.57 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  44.48 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  44.15 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  44.15 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.38 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  43.81 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  43.81 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  42.62 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.48 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  41.06 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 341 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  41.08 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  41.08 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  37.26 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.23 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.66 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  41.93 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  41 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.53 
 
 		 349 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  40.49 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 		 343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  37.97 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.5 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  40.56 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  40.56 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.95 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  40.56 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.26 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.73 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  39.73 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  37.19 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  39.88 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>