More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09560 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
322 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  50.5 
 
 
350 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  47.48 
 
 
324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  45.98 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  50.16 
 
 
314 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
336 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  48.23 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  48.05 
 
 
309 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  46.23 
 
 
336 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  48.84 
 
 
311 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  46.95 
 
 
309 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  47.16 
 
 
345 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  46.62 
 
 
333 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  50.36 
 
 
327 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  51.19 
 
 
319 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 
325 aa  255  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  49.67 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  46.42 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  43.85 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  43.85 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  44 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  45.69 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  46.18 
 
 
342 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  46.98 
 
 
311 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  45.08 
 
 
322 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  47.47 
 
 
314 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  49.02 
 
 
333 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  45.25 
 
 
317 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 
311 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
311 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 
311 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 
311 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
327 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  46.64 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  46.64 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  47.26 
 
 
322 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.8 
 
 
311 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  46.64 
 
 
311 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  46.31 
 
 
311 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  46.64 
 
 
311 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  48.98 
 
 
328 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.39 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  45.05 
 
 
310 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  47.39 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  45.67 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.78 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  45.8 
 
 
835 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  47.88 
 
 
335 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  43.61 
 
 
321 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  46.62 
 
 
321 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  46.62 
 
 
321 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  46.62 
 
 
321 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  46.62 
 
 
321 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  46.62 
 
 
321 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  46.3 
 
 
321 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  47.52 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 
334 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 
334 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
327 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  47.19 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  47.19 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  46.86 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  47.19 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  47.19 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  43.16 
 
 
334 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  43.3 
 
 
327 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  45.97 
 
 
322 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  46.02 
 
 
323 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  45.97 
 
 
343 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  45.94 
 
 
323 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  44.3 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  45.97 
 
 
349 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  46.78 
 
 
328 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  47.19 
 
 
337 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  45.23 
 
 
333 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.72 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  45.97 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  44.9 
 
 
332 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  43.44 
 
 
324 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 
315 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  45.07 
 
 
349 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  49.83 
 
 
313 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  46.85 
 
 
319 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  46.8 
 
 
315 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  44.87 
 
 
345 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  44.87 
 
 
345 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  44.87 
 
 
345 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  43.27 
 
 
341 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  48.1 
 
 
327 aa  228  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
345 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  44.2 
 
 
345 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>