More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0344 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 347 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  51.05 
 
 		 367 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6093  Monosaccharide-transporting ATPase  49.1 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  44.84 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.71 
 
 		 348 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.53 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 353 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.89 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.89 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.11 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.56 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.26 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.26 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  37.31 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.25 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.02 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.02 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  43.52 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  37.95 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.18 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.22 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.18 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  38.44 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 		 835 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.79 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.33 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.46 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  35.88 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  35.88 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  35.88 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.84 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  41.5 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.05 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  41.83 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  34.67 
 
 		 360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  40.99 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  36.66 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>