More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1365 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
349 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  46.55 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0344  monosaccharide-transporting ATPase  45.95 
 
 
347 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.324095  normal  0.0533702 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  42.55 
 
 
348 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  44.89 
 
 
308 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  41.82 
 
 
346 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 
346 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3970  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265125  normal  0.0124172 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.51 
 
 
310 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.51 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  40.45 
 
 
350 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 
835 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.83 
 
 
350 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
383 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37 
 
 
324 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.71 
 
 
333 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 
360 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  44.3 
 
 
319 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.87 
 
 
327 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
354 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 
345 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.39 
 
 
336 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
353 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.09 
 
 
342 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  43.37 
 
 
342 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 
353 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
310 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  43.37 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.18 
 
 
345 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.26 
 
 
345 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
310 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
331 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  36.23 
 
 
381 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  36.23 
 
 
381 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
381 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 
337 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.26 
 
 
336 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  37.69 
 
 
365 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.13 
 
 
333 aa  168  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 
334 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
336 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.8 
 
 
334 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
355 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 
347 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.91 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.93 
 
 
341 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  37.73 
 
 
359 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.93 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  38.08 
 
 
365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.73 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
325 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.54 
 
 
334 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  40.88 
 
 
338 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
311 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  39.21 
 
 
355 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6093  Monosaccharide-transporting ATPase  41.62 
 
 
344 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  37.06 
 
 
360 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  34.38 
 
 
357 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.32 
 
 
323 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
343 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 
319 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.37 
 
 
346 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.22 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.22 
 
 
311 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
341 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 
348 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 
315 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
331 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.11 
 
 
360 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  40.88 
 
 
319 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.22 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 
327 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
342 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 
311 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 
349 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.85 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.85 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
320 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.85 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.26 
 
 
335 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  38.19 
 
 
322 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  41.18 
 
 
308 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1852  monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 
330 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
363 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  35.95 
 
 
334 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  34.25 
 
 
363 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>