More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0362 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  100 
 
 		 383 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  77.46 
 
 		 346 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  76.29 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  76.88 
 
 		 346 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  75.64 
 
 		 353 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  75.93 
 
 		 353 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  43.91 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  46.88 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  44.62 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  44.62 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  49.69 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  44.35 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 365 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  48.48 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  46.45 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  50.33 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  47.48 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.87 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 835 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  41.54 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.25 
 
 		 327 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.39 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  41.69 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  40.55 
 
 		 321 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  44.37 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.49 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  44.37 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  42.9 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.89 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.69 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  40.25 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.96 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.96 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.96 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  41.29 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.47 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  40.43 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  45.08 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  43.08 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 334 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.44 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.44 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.02 
 
 		 334 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.92 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 		 311 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.9 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.9 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.48 
 
 		 311 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.57 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.57 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.53 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.57 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.47 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  41.77 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  40.25 
 
 		 314 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>