More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2914 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  97.69 
 
 
346 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
346 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  84.97 
 
 
350 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  78.07 
 
 
353 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  77.78 
 
 
353 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  77.46 
 
 
383 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 
354 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  49.69 
 
 
355 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  48.34 
 
 
355 aa  285  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  51.86 
 
 
355 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  51.36 
 
 
365 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  49.86 
 
 
354 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  48.62 
 
 
381 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  48.62 
 
 
381 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 
381 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  54 
 
 
354 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  49.57 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  50.8 
 
 
365 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  42.94 
 
 
327 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.26 
 
 
327 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  42.77 
 
 
324 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.9 
 
 
322 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 
322 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
835 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.54 
 
 
336 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.99 
 
 
322 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.98 
 
 
310 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  45.66 
 
 
310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.96 
 
 
334 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  42.3 
 
 
323 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
334 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
334 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  41.9 
 
 
321 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.54 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  42.15 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  39.39 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  42.59 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.07 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.59 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.89 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  42.86 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  44.27 
 
 
310 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
321 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  42.45 
 
 
347 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.54 
 
 
345 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
331 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.11 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
345 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  42.07 
 
 
336 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.27 
 
 
341 aa  208  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.03 
 
 
312 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.55 
 
 
345 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.14 
 
 
311 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.14 
 
 
311 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
309 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.14 
 
 
311 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  45.55 
 
 
334 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  43.23 
 
 
311 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  43.23 
 
 
311 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  43.23 
 
 
311 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  42.55 
 
 
314 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.23 
 
 
311 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.26 
 
 
311 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.9 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.9 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.35 
 
 
334 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
348 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  40.59 
 
 
338 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.78 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  43.51 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.72 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  43.87 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.68 
 
 
328 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  39.17 
 
 
333 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.77 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.19 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>