More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0712 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  100 
 
 		 310 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  45.12 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  45.12 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  45.12 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  46.26 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  46.26 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  46.26 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.77 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.43 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.44 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 835 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.33 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  41.14 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  44.37 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.33 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  45.12 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.9 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.96 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.66 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  46.33 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  44.37 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  41.94 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2473  monosaccharide-transporting ATPase  44.33 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  45.12 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  44.78 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  44.37 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  44.37 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  44.44 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  42.57 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.38 
 
 		 337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  44.27 
 
 		 346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  42.17 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.3 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  44.48 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  43.45 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  44.16 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 		 324 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 343 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  42.54 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  44.19 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  44.19 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  44.19 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  44.19 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  44.19 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  43.85 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.21 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  43.85 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.33 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.41 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.61 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  43.83 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6163  inner-membrane translocator  45.74 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000865468 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  43.24 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>