More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1881 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 311 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1600  ribose transport system permease protein rbsC  98.96 
 
 		 193 aa  360  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121047  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  55.52 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  55.19 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  58.63 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  55.02 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  54.22 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  53.87 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  53.87 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  53.55 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  53.55 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  54.87 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  53 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  53.55 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  53.55 
 
 		 311 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  53.23 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  53.55 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  53.23 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  53.55 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  53.23 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  53.51 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  51.12 
 
 		 350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  55.34 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  51.9 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  55.13 
 
 		 314 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  55.02 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  52.43 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  53.47 
 
 		 323 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  53.57 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  53.9 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  56.31 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  52.43 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  55 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  54.49 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  48.16 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  50.34 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  50.34 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  50.34 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  52.88 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  46.35 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  46.93 
 
 		 835 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  46.95 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  46.77 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  46.95 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  46.47 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.45 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  46.5 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  46.5 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  46.5 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  49.16 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.53 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 325 aa  261  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 342 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  49.47 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  49.16 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  48.82 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  48.95 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  47.44 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  49.12 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  48.48 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  46.04 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  48.49 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  46.77 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  46.77 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  46.77 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  46.77 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  48.16 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  45.9 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  45.54 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  50.68 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  45 
 
 		 346 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  45.9 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  47.83 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  50.34 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 		 332 aa  248  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  46.6 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  47.85 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  46.62 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  43.73 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  44.52 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  47.84 
 
 		 349 aa  244  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  48.31 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>