More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0625 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
345 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  97.39 
 
 
345 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  94.2 
 
 
345 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  96.81 
 
 
345 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  97.39 
 
 
345 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  97.1 
 
 
345 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  96.76 
 
 
347 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  84.47 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  83.54 
 
 
339 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  75.93 
 
 
341 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  73.29 
 
 
341 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  69.7 
 
 
333 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  73.99 
 
 
341 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  61.71 
 
 
334 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  63.44 
 
 
328 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  49.84 
 
 
327 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  52.35 
 
 
276 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.25 
 
 
324 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.27 
 
 
323 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  46.03 
 
 
322 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  47.39 
 
 
327 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  44.27 
 
 
343 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  43.49 
 
 
327 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  43.49 
 
 
322 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.55 
 
 
336 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.21 
 
 
331 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
345 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.05 
 
 
322 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  47.06 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  39.82 
 
 
354 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
311 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.29 
 
 
330 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
330 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.29 
 
 
330 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
311 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.81 
 
 
311 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  43.48 
 
 
349 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  44.27 
 
 
342 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  43.49 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  43.49 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  43.49 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.49 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  43.49 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  43.49 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
349 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.77 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
328 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  45.03 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.46 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.13 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  43.75 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.67 
 
 
835 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  45.89 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.46 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  43.1 
 
 
338 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  42.59 
 
 
322 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
336 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  45.03 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  45.03 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  45.03 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  46.2 
 
 
321 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.99 
 
 
333 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 
317 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.32 
 
 
322 aa  216  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  43.17 
 
 
324 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 
325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 
322 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.94 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  40.73 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  40.49 
 
 
355 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.09 
 
 
306 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  41.54 
 
 
346 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.07 
 
 
324 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  42.99 
 
 
327 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  41.59 
 
 
319 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  41.54 
 
 
346 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  40.26 
 
 
314 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 
310 aa  210  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  38.34 
 
 
320 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38 
 
 
342 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  45.9 
 
 
318 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
337 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>