More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4657 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
354 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  98.31 
 
 
354 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  87.35 
 
 
355 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  86.76 
 
 
354 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  55.97 
 
 
354 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  55.76 
 
 
355 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  56.4 
 
 
355 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  58.43 
 
 
365 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  58.26 
 
 
381 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  57.98 
 
 
381 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  57.98 
 
 
381 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  49.86 
 
 
346 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  48.99 
 
 
346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  52.4 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  46.92 
 
 
350 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  46.82 
 
 
353 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 
353 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  46.45 
 
 
383 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.24 
 
 
350 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.33 
 
 
324 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.4 
 
 
311 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  43.08 
 
 
311 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41 
 
 
327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  43.08 
 
 
311 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  43.08 
 
 
311 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.08 
 
 
311 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  42.45 
 
 
322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.71 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.45 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  42.68 
 
 
331 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  42.59 
 
 
317 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.68 
 
 
342 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.64 
 
 
324 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.04 
 
 
314 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.07 
 
 
322 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.68 
 
 
342 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.37 
 
 
334 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  41.69 
 
 
322 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
345 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
311 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.32 
 
 
322 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  42.14 
 
 
321 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  42.01 
 
 
321 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  42.47 
 
 
322 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.77 
 
 
345 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
320 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
321 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.69 
 
 
312 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  41.59 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.96 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  41.59 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  41.59 
 
 
345 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  43.1 
 
 
323 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 
347 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
330 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
330 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.94 
 
 
330 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  40.17 
 
 
348 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.25 
 
 
324 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.69 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.69 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  42.36 
 
 
339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  41.49 
 
 
328 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  42.11 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  40.55 
 
 
333 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
835 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  41.24 
 
 
341 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
325 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  40.19 
 
 
320 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 
341 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 
314 aa  209  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.2 
 
 
309 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  40.75 
 
 
318 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
335 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  40.38 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  40.38 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.19 
 
 
337 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>