More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1398 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  100 
 
 
334 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  83.23 
 
 
334 aa  550  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  81.98 
 
 
334 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  81.98 
 
 
334 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  53.52 
 
 
334 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  53.52 
 
 
342 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  53.52 
 
 
342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  53.85 
 
 
345 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  60.25 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  54.83 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  57.69 
 
 
835 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  58.01 
 
 
310 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  57.69 
 
 
310 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  50.16 
 
 
324 aa  295  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  49.23 
 
 
322 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  47.6 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  48.31 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  53.8 
 
 
325 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  48.66 
 
 
322 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  47.75 
 
 
323 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  52.4 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  48.34 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  49.11 
 
 
298 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  47.83 
 
 
322 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  47.46 
 
 
322 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  51.41 
 
 
294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  51.41 
 
 
294 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  46.93 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  45.91 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  51.92 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  48.77 
 
 
328 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  46.97 
 
 
321 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  46.22 
 
 
322 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  45.87 
 
 
312 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  46.58 
 
 
324 aa  259  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  47.06 
 
 
321 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.57 
 
 
311 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
311 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
331 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  51.31 
 
 
336 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
311 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.25 
 
 
311 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.25 
 
 
311 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  47.91 
 
 
321 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  45.57 
 
 
311 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  45.25 
 
 
311 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  47.63 
 
 
314 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  47.59 
 
 
321 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  44.69 
 
 
346 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  47.59 
 
 
321 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  47.59 
 
 
321 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  47.59 
 
 
321 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  47.59 
 
 
321 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  44.94 
 
 
311 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  44.94 
 
 
311 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  48.05 
 
 
320 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  44.62 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  44.62 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  47.08 
 
 
311 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  49.84 
 
 
310 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  48.43 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.9 
 
 
330 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.9 
 
 
330 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.9 
 
 
330 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  49.53 
 
 
313 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.61 
 
 
306 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  43.4 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.77 
 
 
342 aa  242  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  47.44 
 
 
309 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
343 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  45.16 
 
 
343 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  44.83 
 
 
335 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
341 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  45.9 
 
 
336 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 
309 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  45.31 
 
 
333 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  43.02 
 
 
343 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  43.67 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  46.98 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  44.23 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  45.02 
 
 
314 aa  232  6e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  44.69 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  47.59 
 
 
348 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4580  monosaccharide-transporting ATPase  54.81 
 
 
326 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.95 
 
 
337 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
348 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  45.05 
 
 
343 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  47.42 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 
342 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  45.02 
 
 
342 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  45.02 
 
 
342 aa  225  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 
345 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>