More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1400 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  100 
 
 		 327 aa  621  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  63.08 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  59.42 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  67.24 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  53.85 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  52.41 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  51.77 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  48.45 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  51.77 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  51.77 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  51.45 
 
 		 311 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  51.45 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  51.45 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  51.45 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  52.58 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  49.19 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  51.85 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  51.85 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  47.77 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  47.16 
 
 		 309 aa  255  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  52.68 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 314 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  46.45 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.36 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  48.34 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  43.52 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.73 
 
 		 312 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  46.42 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  46.53 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  46.06 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.9 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  46.36 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  47.63 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 345 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 345 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  47.06 
 
 		 345 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  45.54 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  47.48 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  47.52 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  45.51 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  47.32 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  48.22 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.73 
 
 		 345 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  47 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  47 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  47 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  50.32 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  47 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  45.16 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  46.08 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  47 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  44.75 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  45.16 
 
 		 342 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  45.89 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43.54 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  47.8 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  50.96 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  47.55 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  50.96 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  47.42 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  44.2 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  45.45 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  46.2 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  50.17 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  50.32 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  46.56 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  43.38 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  46.13 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  48.94 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.16 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  46.43 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  48.48 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>