More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0184 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  100 
 
 		 326 aa  628  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  85.02 
 
 		 328 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  71.15 
 
 		 319 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  68.65 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  67.94 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  68.03 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  69.35 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  71.95 
 
 		 319 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  69.97 
 
 		 319 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  69.64 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  69.55 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  67.64 
 
 		 335 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  62.38 
 
 		 334 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  53.18 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  47.56 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  49.51 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  46.13 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  48.9 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.06 
 
 		 363 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  46.06 
 
 		 363 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  46.67 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  47.4 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  45.99 
 
 		 360 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  45.23 
 
 		 357 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  47.23 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  47.99 
 
 		 354 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  46.3 
 
 		 354 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.19 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  45.57 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  43.81 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.43 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.07 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.07 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.11 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.27 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.27 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.41 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.41 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.41 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  41.1 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 		 835 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.67 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.41 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  38.76 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 314 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  43.43 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.4 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.98 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.35 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  40.8 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  39.59 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  40.63 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  40.63 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  40.63 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  40.63 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.46 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  41.94 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.42 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  39 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>