More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0947 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  100 
 
 
319 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  67.96 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  60.54 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  51.44 
 
 
333 aa  301  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.83 
 
 
322 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  50.32 
 
 
310 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  50.32 
 
 
310 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  48.4 
 
 
311 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  50.32 
 
 
835 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  46.64 
 
 
309 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  55.03 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  46.91 
 
 
306 aa  252  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  47.08 
 
 
345 aa  251  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  49.36 
 
 
311 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  46.86 
 
 
330 aa  250  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  50 
 
 
311 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
330 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  47.96 
 
 
350 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  46.86 
 
 
330 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  49.04 
 
 
311 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  49.04 
 
 
311 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  48.72 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  48.72 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  48.72 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  49.22 
 
 
314 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  48.4 
 
 
311 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  48.4 
 
 
311 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  48.4 
 
 
311 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  48.4 
 
 
311 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  49.68 
 
 
336 aa  245  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  45.82 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  52.82 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  45.37 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  48.39 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  45.74 
 
 
334 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  45.74 
 
 
334 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
334 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  44.73 
 
 
317 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.91 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  46.23 
 
 
310 aa  235  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  47.01 
 
 
343 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  45.22 
 
 
324 aa  235  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2400  ribose ABC transporter, permease protein  54.13 
 
 
334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.51 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.51 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  45.85 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  45.96 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
342 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  45.77 
 
 
322 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.83 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2256  inner-membrane translocator  52.82 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0269001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  45.79 
 
 
325 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  47.67 
 
 
334 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  45.95 
 
 
310 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  48.01 
 
 
349 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  43.81 
 
 
328 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  45.45 
 
 
342 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  44.86 
 
 
322 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  47.71 
 
 
349 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
331 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  46.77 
 
 
349 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  47.7 
 
 
308 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
342 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  45.45 
 
 
315 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  47.66 
 
 
314 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  45.73 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  47.42 
 
 
343 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  47.42 
 
 
343 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  45.86 
 
 
298 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  45.79 
 
 
321 aa  225  9e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  50.51 
 
 
313 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  47.42 
 
 
343 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  45.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  48.05 
 
 
343 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  45.65 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  45.48 
 
 
321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3127  monosaccharide-transporting ATPase  50.5 
 
 
324 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.960892  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  48.5 
 
 
335 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  44.55 
 
 
321 aa  222  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  44.66 
 
 
320 aa  221  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  43.75 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  44.67 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  47.51 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.2 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  48.11 
 
 
336 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  44.13 
 
 
327 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  44.44 
 
 
322 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  43.99 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>