More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0504 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  100 
 
 		 357 aa  705    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  65.75 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  65.75 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  65.36 
 
 		 357 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  65.75 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  66.01 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  62.32 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  63.41 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  62.33 
 
 		 360 aa  431  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  62.75 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  64 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  58.74 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  58.74 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  53.63 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  52.15 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  43.61 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  43.79 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 326 aa  262  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  48.08 
 
 		 335 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  45.63 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  44.05 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 322 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  42.59 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.83 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  43.18 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.97 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.19 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.75 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.18 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.75 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.75 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.42 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.42 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.73 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  33.24 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  35.83 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.1 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.88 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.35 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.35 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 330 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.54 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.87 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 325 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 835 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.13 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.08 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.85 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.84 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  31.7 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.82 
 
 		 312 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  33.93 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  33.63 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.11 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.7 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  33.54 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1971  monosaccharide-transporting ATPase  31.01 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.75 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1607  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>