More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2414 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 360 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  64.74 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  58.5 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  57.22 
 
 		 360 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  55.4 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  55.4 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  55.46 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  55.74 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  54.85 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  55.75 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  53.63 
 
 		 357 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  54.62 
 
 		 360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  53.87 
 
 		 350 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  55.27 
 
 		 354 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  51.47 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  51.68 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  50.81 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  49.19 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  51.66 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  49.51 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  46.9 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  48.75 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  47.4 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  49.34 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  48.86 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  45.92 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  45.28 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  47.62 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.72 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.73 
 
 		 835 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.72 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.56 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 345 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.56 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.81 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.67 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  37.79 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  38.94 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.25 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.35 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  38.56 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.91 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.25 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.61 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  36.14 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 405 aa  169  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  38.62 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.28 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2602  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.14 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.64 
 
 		 323 aa  166  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  37.09 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.2 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.2 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.98 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.2 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.2 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  36.21 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0492  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302976  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.03 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>