More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2826 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  100 
 
 
342 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  80.38 
 
 
333 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.08 
 
 
320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
334 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
334 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  43.79 
 
 
334 aa  222  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.86 
 
 
310 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.86 
 
 
310 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 
835 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  42.41 
 
 
317 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  42.46 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 
311 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 
311 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  45.88 
 
 
311 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.52 
 
 
311 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 
311 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.52 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.52 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
331 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  38.53 
 
 
345 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
345 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  38.53 
 
 
345 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.52 
 
 
346 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  38.64 
 
 
345 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  44.03 
 
 
311 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  45.16 
 
 
311 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  45.16 
 
 
311 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  44.44 
 
 
341 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  40.76 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.14 
 
 
331 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  46.64 
 
 
327 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
311 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.63 
 
 
350 aa  206  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
328 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  42.03 
 
 
328 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  42.64 
 
 
340 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.34 
 
 
311 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.48 
 
 
322 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.08 
 
 
345 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
315 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  43.26 
 
 
308 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 
354 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.23 
 
 
347 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.31 
 
 
309 aa  202  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  42.38 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.48 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  42.62 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  42.62 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  42.62 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.69 
 
 
334 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.88 
 
 
314 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  45.18 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  40.2 
 
 
318 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  45.18 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  43.67 
 
 
322 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.09 
 
 
336 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  42.35 
 
 
348 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.18 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  45.18 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  38.48 
 
 
345 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.49 
 
 
327 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.38 
 
 
306 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
346 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  42.27 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.81 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  36.88 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  38.32 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  45.85 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  39.53 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.02 
 
 
343 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 
345 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.65 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.58 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 
332 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
336 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  44.52 
 
 
345 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
330 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  44.19 
 
 
339 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  43.05 
 
 
333 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 
330 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.67 
 
 
330 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  43.31 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  43.31 
 
 
344 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
313 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.82 
 
 
310 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.28 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  44.21 
 
 
338 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  39.01 
 
 
334 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.18 
 
 
323 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  39.37 
 
 
324 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>