More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3311 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 341 aa  664    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  80.52 
 
 		 363 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  82.15 
 
 		 351 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1889  monosaccharide-transporting ATPase  82.35 
 
 		 341 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.94083  normal  0.398582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1404  monosaccharide-transporting ATPase  81.18 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4570  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  81.76 
 
 		 341 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1345  monosaccharide-transporting ATPase  81.47 
 
 		 341 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0944  inner-membrane translocator  81.18 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1306  inner-membrane translocator  81.47 
 
 		 341 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1426  inner-membrane translocator  81.18 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1243  sugar transmembrane ABC transporter protein  81.47 
 
 		 341 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  64.92 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  67.74 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  65.28 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  64.99 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  63.72 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  65.73 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  68.4 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  63.75 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  67.39 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  61.56 
 
 		 342 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  48.92 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.56 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.26 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  44.76 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  43.58 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.64 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  39.1 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  39.37 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.01 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.89 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.66 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  43.66 
 
 		 835 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.25 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  41.9 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.31 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  43.26 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.33 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.55 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 326 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40.73 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.2 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.07 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  41.38 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.07 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 346 aa  189  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.83 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  43.4 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.88 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  39.67 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.67 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.67 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  36.98 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.42 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.98 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.06 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.58 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  43.26 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  38.99 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  39.63 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  39.33 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  41.07 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  40.86 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.86 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  39.6 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>