More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2822 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
338 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  78.79 
 
 
341 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  78.18 
 
 
341 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  81.93 
 
 
341 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  74.18 
 
 
344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  67.16 
 
 
341 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  70.62 
 
 
343 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  67.16 
 
 
336 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  65.98 
 
 
341 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  68.4 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  66.56 
 
 
351 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1243  sugar transmembrane ABC transporter protein  67.56 
 
 
341 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  65.73 
 
 
363 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4570  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  67.19 
 
 
341 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1306  inner-membrane translocator  67.61 
 
 
341 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1345  monosaccharide-transporting ATPase  67.61 
 
 
341 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1889  monosaccharide-transporting ATPase  67.19 
 
 
341 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.94083  normal  0.398582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0944  inner-membrane translocator  67.61 
 
 
341 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1426  inner-membrane translocator  67.61 
 
 
341 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1404  monosaccharide-transporting ATPase  67.61 
 
 
341 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  63.12 
 
 
342 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  47.94 
 
 
336 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  45.58 
 
 
342 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  45.58 
 
 
342 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  45.24 
 
 
334 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  42.09 
 
 
338 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  41.22 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
334 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.52 
 
 
334 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.64 
 
 
334 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.39 
 
 
350 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.19 
 
 
310 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.88 
 
 
310 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 
835 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  41.09 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40.81 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  44.9 
 
 
328 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  41.55 
 
 
343 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  41.22 
 
 
343 aa  208  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
330 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.36 
 
 
345 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  41.59 
 
 
325 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  40.6 
 
 
317 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.49 
 
 
324 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.97 
 
 
309 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.23 
 
 
322 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  43.58 
 
 
327 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.68 
 
 
342 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  40.24 
 
 
342 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 
345 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.78 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.78 
 
 
311 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
311 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.43 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.43 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  45.36 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.13 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.96 
 
 
314 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
348 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 
310 aa  195  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
321 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.28 
 
 
324 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
330 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.72 
 
 
330 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.72 
 
 
330 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.13 
 
 
323 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.27 
 
 
306 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  38.69 
 
 
337 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  38.08 
 
 
328 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  42.95 
 
 
327 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  42.3 
 
 
322 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.16 
 
 
334 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
327 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.98 
 
 
358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  40.32 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  39.18 
 
 
341 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.59 
 
 
339 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  41.09 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
322 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  37.1 
 
 
341 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.06 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  40.36 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  40.36 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  38.08 
 
 
342 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  38.08 
 
 
342 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  40.36 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  42.76 
 
 
322 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>