More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0412 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
328 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  63.64 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  61.56 
 
 
341 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  62.42 
 
 
345 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  62.42 
 
 
345 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  62.7 
 
 
345 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  62.42 
 
 
345 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  62.65 
 
 
334 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  62.19 
 
 
345 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  62.74 
 
 
347 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  61.25 
 
 
341 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  63 
 
 
339 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  60.44 
 
 
342 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  62.19 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  54.32 
 
 
333 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  47.95 
 
 
405 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  49.82 
 
 
327 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  45.71 
 
 
322 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  49.29 
 
 
276 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.86 
 
 
327 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  44.06 
 
 
328 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  44.81 
 
 
314 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.95 
 
 
342 aa  225  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.56 
 
 
336 aa  225  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
311 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.86 
 
 
311 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.86 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.86 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
311 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.55 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.55 
 
 
311 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.37 
 
 
331 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.17 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.24 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  39.49 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.14 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2011  monosaccharide-transporting ATPase  41.74 
 
 
328 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  42.3 
 
 
333 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  42.27 
 
 
327 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 
350 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.96 
 
 
327 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  40.61 
 
 
345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  40.8 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.45 
 
 
324 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.59 
 
 
322 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  45.27 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 
333 aa  215  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  40.38 
 
 
323 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.51 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.51 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.32 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
319 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.78 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  45.03 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  44.05 
 
 
325 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  43.69 
 
 
310 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
342 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
342 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
342 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
317 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  40.95 
 
 
321 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  41.84 
 
 
309 aa  209  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
334 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  40.58 
 
 
322 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 
349 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
334 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.25 
 
 
315 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.13 
 
 
324 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  41.83 
 
 
313 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  39.63 
 
 
343 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
334 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  40.62 
 
 
349 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  38.92 
 
 
321 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.51 
 
 
323 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 
334 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
343 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 
317 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 
342 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  40.13 
 
 
334 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
342 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  38.73 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  38.73 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  38.73 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  38.73 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  38.73 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 
341 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>