More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1704 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  100 
 
 
330 aa  633  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  54.73 
 
 
342 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  54.73 
 
 
342 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  54.05 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.03 
 
 
337 aa  319  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.97 
 
 
336 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2997  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.32 
 
 
336 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.38 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2325  inner-membrane translocator  48.05 
 
 
340 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2465  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.67 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2564  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.67 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3019  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.37 
 
 
336 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2295  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575488  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02077  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1510  Monosaccharide-transporting ATPase  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.904375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02036  hypothetical protein  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2443  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2282  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0823  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.64113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1500  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2535  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.943275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2334  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2427  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2423  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3281  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  52.45 
 
 
336 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.692353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2378  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.53 
 
 
336 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  47.66 
 
 
336 aa  249  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  44.63 
 
 
360 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2748  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  51.84 
 
 
336 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.845248  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0319  inner-membrane translocator  45.2 
 
 
362 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 
341 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
334 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
334 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.69 
 
 
334 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
341 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  45.15 
 
 
363 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  42.31 
 
 
341 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  39.37 
 
 
318 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0821  Monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
551 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  43.81 
 
 
341 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  43.67 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  41.43 
 
 
342 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  42.25 
 
 
338 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2215  galactoside ABC transporter, permease protein, putative  36.92 
 
 
564 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  42.29 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  39.81 
 
 
338 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
330 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.8 
 
 
330 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.8 
 
 
330 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 
350 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.53 
 
 
334 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.19 
 
 
342 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
331 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
342 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
324 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.42 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  39.69 
 
 
338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.42 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.11 
 
 
324 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
342 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 
311 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40 
 
 
311 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
835 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 
306 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
311 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
320 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1243  sugar transmembrane ABC transporter protein  45.29 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.67 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.67 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4570  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
341 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.67 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1345  monosaccharide-transporting ATPase  41.34 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1306  inner-membrane translocator  41.34 
 
 
341 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
309 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1889  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 
341 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.94083  normal  0.398582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 
345 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 
345 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0944  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
341 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
311 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1404  monosaccharide-transporting ATPase  44.57 
 
 
341 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1426  inner-membrane translocator  44.57 
 
 
341 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 
345 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.47 
 
 
334 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
346 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  36.53 
 
 
345 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
345 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
345 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.95 
 
 
323 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  37.46 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>