More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1464 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  99.71 
 
 		 345 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 345 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  96.52 
 
 		 345 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  95.94 
 
 		 345 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  95.94 
 
 		 345 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  95.94 
 
 		 345 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  94.49 
 
 		 345 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  90.62 
 
 		 344 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  90.62 
 
 		 344 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  90.62 
 
 		 344 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  86.76 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  72.86 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  66.38 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  66.29 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  68.97 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2862  monosaccharide-transporting ATPase  69 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0408781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  57.35 
 
 		 331 aa  358  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  56.51 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  58.01 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  58.01 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  58.01 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  58.99 
 
 		 324 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  58.02 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.17 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  46.04 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.19 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.19 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  48.08 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  47.74 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  46.73 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  47.39 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  47.39 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  48.43 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  44.28 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.72 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.65 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 835 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  45.02 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.13 
 
 		 342 aa  209  7e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  43.79 
 
 		 334 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  43.49 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.56 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  44.11 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  40.68 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.04 
 
 		 310 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.04 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  40.85 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 311 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 324 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.36 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.33 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  39.7 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.3 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  46.67 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  42.5 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  41.28 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  43.96 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  43.13 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.71 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  46.78 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  42.28 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  38.44 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.19 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.12 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.79 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  44.33 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  41.52 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  44.7 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>