More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3108 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
313 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  53.55 
 
 
315 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  53.44 
 
 
316 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  52.94 
 
 
348 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  46.79 
 
 
325 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  46.58 
 
 
320 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  46.5 
 
 
324 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  52.8 
 
 
322 aa  249  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  46.03 
 
 
311 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.7 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.7 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  46.03 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.7 
 
 
311 aa  238  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  46.03 
 
 
311 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  44.77 
 
 
331 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  46.03 
 
 
311 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.7 
 
 
311 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.7 
 
 
311 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.7 
 
 
311 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.05 
 
 
311 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  46.41 
 
 
348 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
314 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  45.72 
 
 
341 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  44.27 
 
 
331 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  45.08 
 
 
330 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  45.08 
 
 
330 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  45.08 
 
 
330 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.09 
 
 
342 aa  222  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.64 
 
 
313 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  45.05 
 
 
327 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  43.9 
 
 
322 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 
330 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  41.16 
 
 
314 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.71 
 
 
330 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  44.73 
 
 
327 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.71 
 
 
330 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  47.08 
 
 
323 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  44.28 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  42.62 
 
 
336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.17 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  43.46 
 
 
327 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.62 
 
 
350 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 
342 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.37 
 
 
342 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  44.07 
 
 
318 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.37 
 
 
334 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  39.29 
 
 
333 aa  209  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  43.57 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  43.75 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  43.26 
 
 
345 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 
309 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  43.57 
 
 
345 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  43.26 
 
 
345 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  43.57 
 
 
345 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  43.57 
 
 
345 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 
334 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 
334 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 
312 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  44.04 
 
 
338 aa  206  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.92 
 
 
334 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.42 
 
 
309 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 
306 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.3 
 
 
325 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  44.34 
 
 
324 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  38.77 
 
 
345 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
331 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.39 
 
 
324 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  38.27 
 
 
327 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.47 
 
 
310 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.47 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  42.52 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  42 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  42.09 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  45.02 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.13 
 
 
322 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  39.48 
 
 
332 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  42.26 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  42.26 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.33 
 
 
336 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.14 
 
 
835 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.3 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 
339 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  43.65 
 
 
340 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  43.27 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  43.27 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  43.27 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  43.27 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  43.27 
 
 
321 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.13 
 
 
333 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  39.59 
 
 
316 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  42.68 
 
 
324 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  39.58 
 
 
335 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 
333 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.47 
 
 
335 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  39.58 
 
 
335 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.56 
 
 
322 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  41.14 
 
 
322 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>