More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5600 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  100 
 
 		 324 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  95.33 
 
 		 331 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  87.81 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  87.81 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  87.81 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  85.58 
 
 		 341 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  64.05 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  59.38 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  67.31 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  59.56 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  60.31 
 
 		 344 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  60.31 
 
 		 344 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  58.99 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  58.99 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  58.99 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  58.99 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  58.99 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  58.99 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  61.17 
 
 		 339 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  60.62 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  57.89 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  56.1 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2862  monosaccharide-transporting ATPase  59.57 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0408781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  50.83 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  45.86 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.22 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.22 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  44.9 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  45 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  44.9 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  44.9 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.9 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  45.82 
 
 		 322 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.58 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  44.89 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 		 835 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  46.1 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  44.87 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.34 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  44.27 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  46.88 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  43.24 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  42.41 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  45.32 
 
 		 336 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.96 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.23 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  45.45 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.69 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  42.73 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  43.79 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  44.08 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  42.46 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  38.98 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  43.64 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.16 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.33 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  42.55 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  41.54 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.67 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  41.93 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.16 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.46 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  44.23 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>