More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2862 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2862  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 345 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0408781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  73.37 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  71.43 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  70.82 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  69.3 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  69 
 
 		 345 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  69.3 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  69 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  70.21 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  70.52 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  70.52 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  71.21 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  69 
 
 		 345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  69 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  70.82 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  70.34 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  59.57 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  58.98 
 
 		 341 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  57.18 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  57.18 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  57.18 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  59.57 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  59.04 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  50.87 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  48.91 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.76 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  44 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  43.51 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  47.89 
 
 		 835 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.56 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  44.8 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.15 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.15 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.4 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.4 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  46.85 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  46.85 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.71 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  46.5 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  46.5 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  42.05 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  46.85 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  48.59 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  42.05 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.85 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  41.69 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  41.95 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  44.95 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  42.34 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  46.21 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  46.5 
 
 		 336 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  41.58 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  46.69 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  42.51 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.54 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  48.78 
 
 		 342 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.71 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  47.7 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.26 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  42.14 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  38.61 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.14 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  42.76 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  45.23 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  42.49 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.08 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  45.58 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  40.92 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  43.21 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  39.02 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>