More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4135 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  100 
 
 		 321 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.51 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  45.04 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.86 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.86 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.53 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.86 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.53 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.71 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  39.32 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  47.16 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.92 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.58 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.23 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.23 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.23 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  44.11 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  39.06 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.11 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 835 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  41.21 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.67 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.68 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  41.19 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  41.19 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  40.3 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40.6 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  41.89 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.35 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.77 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.77 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  45.24 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.07 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.03 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.15 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  42 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  40.79 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.4 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  40.79 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  41.78 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  38.17 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.64 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.13 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 345 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.31 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  40.33 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  40.94 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.77 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.3 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.31 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  42.23 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  35.98 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  40 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  37.21 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>