More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0285 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
344 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  99.71 
 
 
344 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 
344 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  95.29 
 
 
339 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  86.09 
 
 
345 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  85.63 
 
 
345 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  85.8 
 
 
345 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  85.8 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  86.38 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  85.8 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  86.67 
 
 
345 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  72.38 
 
 
340 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  67.44 
 
 
338 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  70.78 
 
 
346 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2862  monosaccharide-transporting ATPase  68.5 
 
 
345 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0408781  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  67.84 
 
 
339 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  60.19 
 
 
331 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  56.52 
 
 
341 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  60.06 
 
 
330 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  60.06 
 
 
330 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  60.06 
 
 
330 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  60.31 
 
 
324 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2173  inner-membrane translocator  59.43 
 
 
332 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.269741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  43.5 
 
 
350 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  44 
 
 
337 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  50 
 
 
309 aa  228  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  44.58 
 
 
336 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  46.47 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.79 
 
 
311 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  47.13 
 
 
835 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
311 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  44.65 
 
 
334 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.83 
 
 
311 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  45.35 
 
 
348 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  44.65 
 
 
334 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  45.83 
 
 
311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.14 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  45.1 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  47.77 
 
 
334 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  45.51 
 
 
311 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  45.51 
 
 
311 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.14 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.14 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  43.65 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  46.37 
 
 
334 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
333 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  46.37 
 
 
342 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.81 
 
 
342 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  46.37 
 
 
342 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  43.04 
 
 
330 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 
330 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  43.04 
 
 
330 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  42.36 
 
 
322 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
355 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  45.17 
 
 
313 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
329 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.41 
 
 
310 aa  205  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  42.35 
 
 
355 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  40.74 
 
 
348 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  43.03 
 
 
324 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 
340 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  41.21 
 
 
354 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  44.05 
 
 
325 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
325 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 
313 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  40.06 
 
 
317 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  44.59 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.74 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  43.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  43.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  43.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  45.31 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  44.3 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
317 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.88 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  39.83 
 
 
345 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.41 
 
 
324 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  47.72 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  41.99 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.43 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.89 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  42.68 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
345 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  46.33 
 
 
336 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.37 
 
 
341 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
315 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  42.41 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  41.54 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
345 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  41.47 
 
 
339 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  41.85 
 
 
327 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>