More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4580 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 328 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  96.34 
 
 		 328 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  88.65 
 
 		 329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  68.2 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  68.03 
 
 		 326 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  68.17 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  66.67 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  65.92 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  66.25 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  66.77 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  63.09 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  63.64 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  55.84 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  55.05 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  47.66 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  47.4 
 
 		 360 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  48.89 
 
 		 329 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.1 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  46.75 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  43.11 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  44.24 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  41.72 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  44.72 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  44.26 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 354 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  45.45 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.52 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.28 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.52 
 
 		 835 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  39.82 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.7 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  39.88 
 
 		 338 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.58 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  39.94 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.32 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.32 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  38.67 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.39 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.39 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  39.58 
 
 		 345 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  39.87 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  41.96 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.21 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.32 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.75 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.22 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  38.22 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.06 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.39 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.27 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.56 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  39.27 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  39.6 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.51 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.76 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0842  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  38.28 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.3 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.62 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  38.28 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  35.02 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.31 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  35.52 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>