More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1902 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  100 
 
 		 319 aa  624  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  87.66 
 
 		 348 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  75.55 
 
 		 319 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  74.68 
 
 		 317 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  73.44 
 
 		 322 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  71.8 
 
 		 329 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  71.16 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  68.17 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  69.97 
 
 		 326 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  68.98 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  67.99 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  67 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3622  inner-membrane translocator  62.42 
 
 		 334 aa  350  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3129  inner-membrane translocator  59.75 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196604  hitchhiker  0.00122058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  50.69 
 
 		 360 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  52.98 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5756  Monosaccharide-transporting ATPase  53.04 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.166974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  50.51 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.62 
 
 		 360 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  49.35 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  46.39 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  46.45 
 
 		 357 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0989  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 		 363 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  46.43 
 
 		 360 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2649  inner-membrane translocator  46.39 
 
 		 363 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  47.42 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  45.7 
 
 		 364 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2606  monosaccharide-transporting ATPase  46.23 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0126  Monosaccharide-transporting ATPase  47.08 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.86 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  43.27 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.86 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  43.52 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.64 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 		 835 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  42.02 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  44.74 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  43.67 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  42.31 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.44 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.44 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  44.74 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  44.74 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  44.74 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  44.74 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  44.74 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.87 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  38.11 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  38.11 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  43.75 
 
 		 337 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  37.26 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.64 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.89 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  40.85 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 336 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  38.08 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.85 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.77 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  39.93 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  41.33 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  41.33 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.83 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.83 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  41.75 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  40.57 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  39.74 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  41.33 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.8 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>